The present invention relates to fermented coffee using a grape skin juice and isolated yeast, which further enhances safety by using a fermentation technique without going through a roasting process when a raw coffee bean is prepared as a final coffee, and also, improves the consumer preference, and to a preparing method thereof. The preparing method of the present invention comprises: a first step of washing a raw material (coffee beans); a second step of performing first fermentation; a third step of performing a sterilization; a fourth step of performing a refrigerating storage step; a fifth step of performing second fermentation; a sixth step of performing third fermentation; a seventh step of performing drying; and an eighth step of performing packaging and commercialization. Accordingly, the preparing method of a fermented coffee which is not roasted, contains low-concentration caffeine and a large amount of functional substances, and has improved consumer preference, is provided.본 발명은 원료 커피콩을 최종 커피로 제조 시 로스팅(roasting : 볶기)과정을 거치지 아니하고 발효 기술을 이용하여 보다 안전성을 높이는 동시에 소비자 기호도가 향상된 포도 껍질 즙과 분리한 효모를 이용한 발효커피 및 그 제조방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는, 제 1단계는 원료(생두) 세척 단계, 제 2단계는 1차 발효 단계, 제 3단계는 멸균 단계, 제 4단계는 냉장 보관 단계, 제 5단계는 2차 발효 단계, 제 6단계는 3차 발효 단계, 제 7단계는 건조 단계, 제 8단계는 포장 및 제품 단계를 포함하여 식품학적으로는 저(低)농도의 카페인과 기능성 물질의 다량함유와 동시에 소비자 기호도가 향상된 로스팅(roasting : 볶기)을 하지 아니한 발효 커피를 제조하는 방법에 관한 것이다.