The present invention relates to a double-layer fluorescent protein nanoparticles, it is possible to provide a fluorescent protein nanoparticles excellent in fluorescence and light stability by expressing a fluorescent protein is fused to the inner and outer surfaces and the target directional peptide on the outer surface. Fluorescent protein nanoparticles according to the present invention can be utilized for biological imaging applications from excellent fluorescence and light stability.본 발명은 이중층 형광 단백질 나노입자에 관한 것으로, 내부 및 외부 표면에 형광 단백질이 융합되어 있고 외부 표면에는 표적 지향성 펩타이드를 표출함으로써 형광도와 광안정성이 우수한 형광 단백질 나노입자를 제공할 수 있다. 본 발명에 따른 형광 단백질 나노입자는 우수한 형광도와 광안정성으로부터 생체 이미징 용도로 활용될 수 있다.