Compositions and methods relate to sequence alteration of endogenous genomic DNA regions. Certain aspects relate to a method for site specific sequence modification of a target genomic DNA region in a cell comprising the steps of: contacting the cell with an activation composition (a) contacting the cell with a donor Transfecting a transfection composition comprising DNA and (b) a DNA digesting agent, wherein said donor DNA comprises (i) a homologous region comprising a nucleic acid sequence homologous to said target genomic DNA region and (ii) And a sequence modification region, wherein the genomic DNA sequence is specifically modified in the target genomic DNA region.組成物および方法は、内因性ゲノムDNA領域の配列改変に関する。特定の局面は、以下の工程を含む、細胞における標的ゲノムDNA領域の部位特異的な配列改変のための方法に関する:該細胞を活性化組成物と接触させる工程;該細胞に、(a)ドナーDNAと(b)DNA消化剤とを含むトランスフェクション組成物をトランスフェクトする工程であって、該ドナーDNAが、(i)該標的ゲノムDNA領域に相同な核酸配列を含む相同領域と(ii)配列改変領域とを含み、かつゲノムDNA配列が、該標的ゲノムDNA領域において特異的に改変される、工程。