The invention relates to a method for preparing a flour of lipid-rich microalgae, which comprises the following steps: (a) providing a biomass of microalgae comprising more than 50% lipids per dry weight of biomass (b) lysing the microalgae (c) concentrating the microalgae lysate to a solids content of more than 25 wt %, preferably to a solids content of 35 wt % to 50 wt % (d) applying a thermal treatment to the lysate thus concentrated (e) homogenising the lysate obtained in step (d) under high pressure, so as to obtain a stable emulsion and (f) drying said emulsion in order to obtain the microalgae flour.La invención se refiere a un método para preparar una harina de microalgas rica en lípidos que comprende las siguientes etapas: (a) proporcionar una biomasa de microalgas que comprenda más del 50% de lípidos en peso seco de la biomasa (b) lisar las microalgas (c) concentrar el lisado de microalgas hasta un contenido de sólidos de más del 25% en peso, preferentemente hasta un contenido de sólidos de entre el 35% y el 50% en peso (d) aplicar un tratamiento térmico al lisado concentrado de este modo (e) homogeneizar a alta presión el lisado obtenido en la etapa (d) para obtener una emulsión estable (f) secar la emulsión para obtener la harina de microalgas.