The present invention relates to a whey protein-containing beverage and a method for preparing the same, comprising: 1) mixing 3.0 to 7.5 parts by weight of separated whey protein based on 100 parts by weight of purified water; (2) aging the mixed solution at 3 ~ 10 ℃; (3) preparing a protein drink by mixing 3.5 to 7.5 parts by weight of fructose and 3.0 to 6.5 parts by weight of allulose with respect to 105 parts by weight of the mixed solution of step (2), thereby separating the whey protein-containing drink. It can be mass-produced, and it improves flavor by adding fruit flavor in harmony with sour taste peculiar to separated whey protein when drinking, and does not contain preservatives, synthetic flavors, synthetic sweeteners and synthetic pigments. In addition to providing a healthy drink that adheres to, it is possible to prevent the rapid increase in the GI glycemic index during drinking by using naturally occurring saccharide allulose and fructose of zero calorie, a low-sugar high-priced raw material.본 발명은 분리유청단백질 함유 음료 및 이의 제조방법에 관한 것으로, 1) 정제수 100 중량부에 대하여 분리유청단백질 3.0 ~ 7.5 중량부를 혼합하여 혼합액을 제조하는 단계와; (2) 상기 혼합액을 3 ~ 10℃에서 에이징하는 단계와; (3) 상기 (2)단계의 혼합액 105 중량부에 대하여, 결정과당 3.5 ~ 7.5 중량부 및 알룰로오스 3.0 ~ 6.5 중량부를 혼합하여 단백질 음료를 제조하는 단계로 구성됨으로써, 분리유청단백질 함유 음료를 대량 생산할 수 있으며, 음용시 분리유청단백질 특유의 신맛과 조화를 이루는 과일맛을 첨가하여 풍미를 개선하고, 방부제, 합성착향료, 합성감미료 및 합성색소를 포함하고 있지 않아 올바른 4무(無) 원칙을 고수하는 건강한 음료를 제공함은 물론, 당류저감화 고가 원료인 제로칼로리의 자연유래 당류 알룰로오스와 결정과당을 사용하여 음용시 GI 혈당지수가 급격하게 상승되는 것을 미연에 방지할 수 있는 효과가 있다.