A system and a method are used for assisting a user in a surgical procedure. Three dimensional (3D) positioning information about an anatomical structure of interest and 3D positioning information about a surgical tool are acquired. An augmented reality view of spatial relations between the anatomical structure of interest and one or more positions along a path of the surgical tool is created based on the 3D positioning information. The augmented reality view is displayed superimposed over a field of view of the user. The augmented reality view may be displayed on a head-mounted display. Fiducial markers may be placed near the anatomical structure to provide enhanced positioning information to the creation of the augmented reality view. Operation of the surgical tool may be controlled in view of relative positions of the surgical tool and of a given landmark indicative of the anatomical structure.La présente invention concerne un système et un procédé utilisés pour assister un utilisateur durant une intervention chirurgicale. Les informations de positionnement tridimensionnel (3D) sur une structure anatomique d'intérêt et les informations de positionnement 3D sur un outil chirurgical sont acquises. Une vue en réalité augmentée des relations spatiales entre la structure anatomique d'intérêt et une ou plusieurs positions le long d'un trajet de l'outil chirurgical est créée sur la base des informations de positionnement 3D. La vue en réalité augmentée est affichée en superposition sur un champ de vision de l'utilisateur. La vue en réalité augmentée peut être affichée sur un affichage monté sur un visiocasque. Des marqueurs de repère peuvent être placés près de la structure anatomique pour fournir des informations de positionnement améliorées à la création de la vue en réalité augmentée. Le fonctionnement de l'outil chirurgical peut être commandé en vue de positions relatives de l'outil chirurgical et d'un repère donné indicatif de la structure anatomique.