[Problem] Provided are: a composition for transplanting bacterial flora suitable for an animal such as a pet; a production method thereof; a transplantation instrument; and a transplantation method. [Solution] A transplantation method according to the present invention comprises: a filtration step S01 for filtering a turbid liquid 2 including feces obtained from an animal A1; an extraction step S02 for extracting bacterial flora 42 from feces bacterial flora materials by means of centrifugation; a coloring step S03 for adding a dye material 6 to the bacterial flora 42 to produce a composition 5 for transplanting bacterial flora; a storage step S04 for storing, in a transplantation instrument 7, the composition 5 for transplanting bacterial flora; and an injection step S05 for injecting the composition 5 for transplanting bacterial flora through the transplantation instrument 7. The transplantation instrument 7 used herein is provided with: a storage part 7a having a shape in which the composition 5 for transplanting bacterial flora can be stored and compressed; and a tubular injection part 7b connected to the storage part 7a.Le problème à résoudre par la présente invention est de fournir : une composition pour la transplantation de flore bactérienne appropriée pour un animal tel qu'un animal de compagnie ; un procédé de production de celle-ci ; un instrument de transplantation ; et un procédé de transplantation. La solution de la présente invention porte sur un procédé de transplantation comprenant : une étape de filtration (S01) pour filtrer un liquide trouble (2) comprenant des selles provenant d'un animal (A1) ; une étape d'extraction (S02) pour extraire la flore bactérienne (42) des matières de flore bactérienne fécale par centrifugation ; une étape de coloration (S03) pour ajouter un matériau colorant (6) à la flore bactérienne (42) afin de produire une composition (5) pour la transplantation de la flore bactérienne ; une étape de stockage (S04) pour stocker, d