The present invention relates to a manufacturing method of fermented red ginseng having an increased content of ginsenoside Rg3, and more specifically, to a manufacturing method of fermented red ginseng which inoculates an Aspergillus sp. strain and/or Bacillus sp. strain to ginseng steamed for one time to ferment the same and performs repeated steaming and drying steps to increase the content of ginsenoside Rg3; and to a food composition containing the fermented red ginseng manufactured thereby. In case of using the manufacturing method of fermented red ginseng according to the present invention, the method increases ginsenoside Rg3 components having physiological activity and can rapidly and conveniently manufacture fermented red ginseng in line with necessary pharmacological activities such that the present invention may be used in developments of disease treatment drugs, preventing drugs and health functional foods. In addition, the manufacturing method according to the present invention does not need special facilities or equipment, thereby being simple and efficient in terms of costs. Since the present invention purely cultures selected strains only to use the same, thereby preventing cross contamination with other microorganisms.COPYRIGHT KIPO 2020본 발명은 진세노사이드(ginsenoside) Rg3 함량이 증가된 발효홍삼의 제조방법에 관한 것으로, 더욱 자세하게는 1회 증숙한 인삼에 아스퍼질러스(Aspergillus) 속 균주 및/또는 바실러스(Bacillus) 속 균주를 접종하여 발효시킨 후 반복적인 증숙 및 건조 과정을 거쳐 진세노사이드 Rg3 함량을 증진시킨 발효홍삼의 제조방법 및 상기 방법에 의해 제조된 발효홍삼을 포함하는 식품 조성물에 관한 것이다. 본 발명에 따른 발효홍삼의 제조방법을 이용하는 경우, 생리활성을 가지는 진세노사이드 Rg3 성분을 증가시키며 필요한 약리활성에 맞추어 간단하고 빠르게 발효홍삼을 제조할 수 있으므로, 질병치료제, 예방제 및 건강기능식품의 개발에 널리 활용될 수 있을 것이다. 또한, 본 발명에 따른 제조방법은 특별한 시설이나 장비를 요하지 않아 간단하고 비용면에서도 효율적이며, 선발된 균주만을 순수 배양하여 사용하기 때문에 다른 미생물과의 교차 오염의 문제점을 방지하는 효과가 있다.