本发明公开了一种热不稳定的外切菊粉酶突变体MutQ23Δ6及其制备和应用,该突变体MutQ23Δ6具有如SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列,其与野生酶InuAGN25DVS和突变酶MutQ23Δ3相比,MutQ23Δ6在50℃时活性低,在55℃下热稳定性差。经55℃处理5‑30min后,MutQ23Δ6的酶活从62%下降到8%,野生酶InuAGN25DVS的酶活从71%下降到20%,突变酶MutQ23Δ3的酶活从90%下降到22%。本发明的热不稳定的外切菊粉酶突变体MutQ23Δ6可应用于食品、酿酒和生物能源等行业。