The present invention: blocks, with stoppers (300), upper parts of holes (200) of a mold (100) having a plurality of cone-shaped holes (200) formed to be spaced apart and applies pressure thereto, blocks, with the stoppers (300), the upper parts of the holes (200) of the mold (100) and connects lower parts of the holes to a vacuum pump (400), or disposes a pad (600) at a lower part the bottom of the mold and seals the same, and blocks the upper parts of the holes (200) with a vacuum stopper (310) and connects the vacuum pump, so as to drop, in a vacuum state, a biocompatible polymer solution containing the proper amount of active ingredients; and then releases a vacuum, successively pours the biocompatible polymer solution containing the active ingredients (10) and a diluent (20), and solidifies the biocompatible polymer solution, thereby manufacturing biocompatible polymer-based microneedles. The microneedles manufactured by the method resolve problems such as drug degeneration, insufficient hardness, and drug loss, which occur because of complexity and a long manufacturing time, implement painlessness, and can have a diameter, hardness, and length, which enable skin penetration/stimulation.La présente invention : bloque, avec des bouchons (300), les parties supérieures des trous (200) d'un moule (100) ayant une pluralité de trous en forme de cône (200) formés pour être espacés et applique une pression sur celles-ci, bloque, avec les bouchons (300), les parties supérieures des trous (200) du moule (100) et relie les parties inférieures des trous à une pompe à vide (400), ou place un patin (600) au niveau d'une partie inférieure du fond du moule et scelle ce dernier, et bloque les parties supérieures des trous (200) avec un bouchon à vide (310) et raccorde la pompe à vide, de façon à amener, dans un état sous vide, une solution de polymère biocompatible contenant la quantité adaptée de principes actifs ; puis libère un vide, verse successivement la solution de polym