The invention relates to modified Factor IX polypeptides such as Factor IX polypeptides with one or more introduced cysteine sites. The modified Factor IX polypeptides may be conjugated to a biocompatible polymer. The invention also relates to methods of making modified Factor IX polypeptides, and methods of using modified Factor IX polypeptides, for example, to treat patients afflicted with hemophilia B.Linvention concerne des polypeptides du facteur IX modifié, tels que des polypeptides du facteur IX dans lesquels un ou plusieurs sites cystéine ont été introduits. Les polypeptides du facteur IX modifié peuvent être conjugués avec un polymère biocompatible. Linvention concerne également des procédés pour produire des polypeptides du facteur IX modifié, et des méthodes pour utiliser lesdits polypeptides du facteur IX modifié, par exemple, pour traiter des patients souffrant dhémophilie B.