Provided is a method of preparing a granule-type health functional food which includes, as a main ingredient, psyllium husk having a large quantity of dietary fibers, to stimulate defecation, bifidus grain fermented powder, to generate, in large quantities, bifidobacteria which are beneficial intestinal bacteria, and an yeast extract, to relieve intestinal stress and strain so that it is possible to cause stool in the intestine to be smoothly expelled. The method comprises: a mixing step of preparing a mixture by mixing ingredients including psyllium husk, bifidus fermented and mixed powder, plant-mixed powder, kelp powder, Cortex ulmi pumilae powder, a lactobacillus brevis decomposition extract, kudzu root powder, yeast extract powder, ginger extract powder, sodium alginate, organic mixed powder, germinated mung bean powder, tangerine peel fermented extract powder, milk thistle, protease, alpha amylase, lactitol, and fructooligosaccharide; an addition step of preparing dough by adding the mixture with a liquid binding agent; a granule forming step of forming granules using the dough; a dry step of drying the granules; and a coating step of coating surfaces of the dried granules with a coating solution in which HPMC power is mixed with alcohol (ethyl alcohol) having a concentration equal to or greater than 98%.본 발명은 다량의 식이섬유를 함유하고 있는 차전자피를 주성분으로 하여 배변활동을 원활하게 하고, 비피더스곡물발효분말을 함유하여 장 내 유익균인 비피더스균을 다량 생성할 수 있으며, 효모추출물을 함유하여 장 내 스트레스 및 긴장을 완화시켜 장내 배변을 부드럽고 원활하게 배출하도록 도와줄 수 있는 환형 건강기능식품의 제조방법을 제공한다. 본 발명은, 차전자피, 비피더스발효혼합분말, 식물혼합분말, 다시마분말, 유근피분말, 락토바실러스브레비스 분해추출물, 칡뿌리분말, 효모추출물분말, 생강추출물분말, 알긴산나트륨, 유기농혼합분말, 발아녹두분말, 귤껍질발효추출분말, 밀크씨슬, 프로테아제, 알파아밀라아제, 락티톨 및 프락토올리고당으로 이루어지는 원료를 혼합하여 혼합물을 형성하는 혼합단계와, 상기 혼합물을 액상의 결합제와 연합하여 반죽물을 형성하는 연합단계와, 상기 반죽물을 이용하여 구 형상의 환(丸)으로 형성하는 제환단계와, 상기 환을 건조시키는 건조단계와, 상기 건조된 환 표면에 HPMC분말 및 98% 농도 이상의 주정(에틸알코올)을 혼합한 코팅액으로 코팅하는 코팅단계를 포함하여 이루어진다.