PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a method for identifying an actually expressing alternative splicing variant associated with cell properties and diseases.SOLUTION: The actually expressing alternative splicing variant associated with cell properties and diseases is identified by combining transcriptome analysis and proteome analysis. The method includes a step of identifying the base sequence of the splicing variant associated with cell properties by carrying out mRNA sequencing and a step of identifying a protein comprising an amino acid sequence obtained by translating the base sequence of the identified splicing variant as a splicing variant protein. Moreover, the actually expressing alternative splicing variant associated with metastatic properties of stomach cancers is identified by such method.【課題】細胞の性質や疾患に係る、実際に発現している選択的スプライシングバリアントを同定する方法を提供する。【解決手段】トランスクリプトーム解析とプロテオーム解析とを組み合わせることにより、細胞の性質や疾患に係る、実際に発現している選択的スプライシングバリアントを同定する。ｍＲＮＡのシークエンシングを行い、細胞の性質に関与するスプライシングバリアントの塩基配列を同定する工程；同定したスプライシングバリアントの塩基配列を翻訳して得られたアミノ酸配列からなるタンパク質を、スプライシングバリアントタンパク質として同定する工程を含む。さらにかかる方法により、胃がん細胞の転移性に関与する、実際に発現している選択的スプライシングバリアントを同定する。【選択図】なし
