本发明提供一种酶法水解定向制备褐藻胶寡糖的方法，其中使用的褐藻胶裂解酶，其氨基酸序列为SEQ ID NO:3。本发明利用基因改造的重组褐藻胶裂解酶，定向制备褐藻胶寡糖，与现有酸法水解制备褐藻胶寡糖的方法相比，克服了破坏性大、效率低的缺点，与现有的酶法水解制备褐藻胶寡糖的方法相比，运用改造的重组褐藻胶裂解酶，克服了酶解时间长、成本高、不能定向制备特定聚合度的褐藻胶寡糖的缺点。本发明过程简单、成本低且适用于工业化生产，能够在短时间内降低褐藻胶粘度，所制寡糖的总得率在90％以上。所制备的褐藻胶寡糖有抗肿瘤、抗炎、降血脂和提高免疫力等功效，可用于食品及保健品领域，具有广泛的应用前景。
