System for packaging a product to be frozen, comprising a packaging apparatus (56), adapted to place and seal a fluid food product in a flexible container (54); a mold (20, 60), configured to press on and deform at least one surface of the container (54) to produce a series of compartments (14) in the container with thin segments (16) therebetween; and characterized by a pasteurization unit (58), configured to pasteurize the food product in the sealed container (54); and a freezer (62), configured to freeze the product in the container (54) with the mold (20, 60) placed on the at least one surface.Sistema para envasar un producto que va a congelarse, que comprende un aparato (56) de envasado, adaptado para colocar y sellar un producto alimenticio fluido en un recipiente (54) flexible; un molde (20, 60), configurado para presionar sobre y deformar al menos una superficie del recipiente (54) para producir una serie de compartimentos (14) en el recipiente con segmentos (16) finos entre los mismos; y caracterizado por una unidad (58) de pasteurización, configurada para pasteurizar el producto alimenticio en el recipiente (54) sellado; y un congelador (62), configurado para congelar el producto en el recipiente (54) con el molde (20, 60) colocado sobre la al menos una superficie.