THE GOVERNING COUNCIL OF THE UNIVERSITY OF TORONTO
发明人:
GARTON, Michael,NIM, Satra,KIM, Philip M.
申请号：
CACA2019/050026
公开号：
WO2019/134052A1
申请日:
2019.01.08
申请国别(地区):
CA
年份:
2019
代理人:
摘要：
A method for designing in-silico a (D)-polypeptide ligand that binds with a target is provided. The method includes providing a (L)-polypeptide ligand that binds with the target, the (L)-polypeptide ligand comprising one or more (L)-helical region； for each of the one or more (L)-helical region: identifying hotspot residues of the one or more (L)-helical region, that interact with residues of the target； and scanning a (D)-polypeptide database comprising single helix (D)-polypeptide candidates, to determine a single helix (D)-polypeptide match having a residue configuration that matches the hotspot residues of the one or more (L)-helical region； and generating the (D)-polypeptide ligand by combining the single helix (D)-polypeptide match of each of the one or more (L)-helical region.L'invention concerne un procédé in silico de conception d'un ligand (D)-polypeptide se liant à une cible. Le procédé comprend les étapes consistant à fournir un ligand (L)-polypeptide qui se lie à une cible, le ligand (L)-polypeptide comprenant une ou plusieurs régions (L)-hélicoïdales ； pour chacune de ou des régions (L)-hélicoïdales : identifier des résidus hotspot de la ou des régions (L)-hélicoïdales, qui interagissent avec des résidus de la cible ； et balayer une base de données de (D)-polypeptide comprenant des candidats (D)-polypeptide à hélice unique, pour déterminer une correspondance du (D)-polypeptide à hélice unique ayant une configuration du résidu qui correspond aux résidus hotspot de la ou des régions (L)-hélicoïdales ； et générer le ligand (D)-polypeptide par combinaison de la correspondance du (D)-polypeptide à hélice unique à chacune de ou des régions (L)-hélicoïdales.
