The present invention provides a pharmaceutical composition containing a selenite-containing compound and a pharmaceutically acceptable acid, selected from citric acid, acetic acid, malic acid, carbonic acid, sulfuric acid, nitric acid, hydrochloric acid, fruit acids and mixtures thereof. This composition is for use in the prevention or treatment of an infection of an internal reproductive organ of a female patient with at least one human papillomavirus (HPV) selected from HPV16, HPV18, HPV31, HPV33 and HPV58. The composition is applied intravaginally.La présente invention concerne une composition pharmaceutique contenant un composé de sélénite et un acide pharmaceutiquement acceptable, choisi parmi les suivants : l'acide citrique, l'acide acétique, l'acide malique, l'acide carbonique, l'acide sulfurique, l'acide nitrique, l'acide chlorhydrique, les acides de fruits et leurs mélanges. Cette composition est destinée à être utilisée pour la prévention ou le traitement d'une infection d'un organe reproducteur interne chez un patient féminin atteint d'au moins un papillomavirus humain (HPV) parmi les suivants : HPV16, HPV18, HPV31, HPV33 et HPV58. La composition est administrée par voie vaginale.