A production method of microencapsulated probiotics with chitosan-alginate polymers, the microcapsules loaded with probiotics obtained by this method and their use in food, agriculture and cosmetics. The microcapsules do not make alterations in the color and appearance of the product in which they are applied and have antifungal and anti-mycotoxin features.L'invention concerne un procédé de production de la forme microcapsulée de probiotiques avec des polymères de chitosane-alginate, les microcapsules chargées avec des probiotiques obtenus par ce procédé et leur utilisation dans des produits alimentaires, agricoles et cosmétiques. Ces microcapsules n'entraînent aucune altération de la couleur et de l'apparence du produit sur lequel elles sont appliquées et ont des caractéristiques antifongiques et anti-mycotoxines.