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一种鹅掌楸基因组的SNP标记的筛选方法
- 专利权人:
- 南京林业大学
- 发明人:
- 施季森,陆叶,陈金慧,龙晓飞,杨立明,肖保荣,刘阳,陈新颖,张稼霁
- 申请号：
- CN201810543378.4
- 公开号：
- CN108754005A
- 申请日:
- 2018.05.29
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2018
- 代理人:
- 邱兴天
- 摘要：
- 本发明公开了一种鹅掌楸基因组的SNP标记的筛选方法，以北美鹅掌楸‘NK’和鹅掌楸‘LS’杂交获得的F1代个体为材料，以测序得到的鹅掌楸参考基因组为基础，运用Primer5.0软件设计PCR扩增引物并检验引物的扩增效率和特异性，从中挑选27个候选SNP位点进行引物设计，经过PCR扩增后利用琼脂糖凝胶电泳检测筛选结果，并通过种源材料验证，最终获得鹅掌楸基因组的SNP标记。本发明从鹅掌楸基因组数据库中挑选了27个SNP位点进行了引物合成，经过PCR扩增检测后送出测序，结果显示，所有的位点都为真实的SNP位点，说明SNP位点质量可靠，所用标准较好，得到的高质量SNP标记可用于遗传连锁图谱等后续工作。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址：
- http://www.ckcest.cn/home/
