본 발명은 프로폴리스 및 알파피넨 복합물을 유효성분으로 함유하는 병원성 슈퍼박테리아에 대한 항균 조성물에 관한 것이다. 더욱 상세하게는, 프로폴리스 및 알파피넨 복합물을 0.1~0.14 mg/mL 함유하며, 항생제내성균주인 MRSA(methicillin-resistant Staphylococcus aureus)에 대한 항균 활성을 갖는 조성물에 관한 것이다. 본 발명에 따른 조성물은 MRSA의 생장을 저해하는 효능, MRSA의 유기산 생성을 억제하는 효능 및 MRSA의 바이오필름 형성을 억제하는 효능을 보유하고 있다.