Methods for reducing thermophilic spore-forming bacteria that can lead to off-odors and tastes in beverage products, especially fruit or vegetable juice products, are provided. The methods employ one or more peroxy acids that are added to the beverage handling system prior to pasteurization and concentration of the beverage product. Particularly, the peroxy acid is added prior to final filtration of the beverage product upstream of the pasteurizer and concentrator.La présente invention a pour objet des procédés permettant de réduire les bactéries sporulées thermophiles qui peuvent conduire à des odeurs et des goûts atypiques dans des produits de boissons, en particulier des produits de jus de fruits ou de légumes. Les procédés utilisent un ou plusieurs peroxyacides qui sont ajoutés au système de manipulation de boissons avant pasteurisation et concentration du produit de boisson. En particulier, le peroxyacide est ajouté avant la filtration finale du produit de boisson en amont du pasteurisateur et du concentrateur.