PURPOSE: A producing method of functional fermented food, and the functional fermented food are provided to enhance the liver function of a user, and to maximize a pharmacological effect of a thiazolidine compound. CONSTITUTION: A producing method of functional fermented food comprises the following steps: adding a thiazolidine formation inducing material during a fermenting process of fermented food materials; and fermenting the mixture. The content of a thiazolidine compound in the final fermented food is greater than 0.01mg/L. The thiazolidine formation inducing material is selected from cysteine, homocysteine, selenocysteine, methionine, amino acids of cysteine, cysteamine, homocysteamine, penicillamine, or their derivatives.본 발명은 i) 발효식품 원료에 발효 초기 또는 발효 과정 중간에 티아졸리딘 생성 유도 물질을 첨가하는 단계; 및 ii)상기 티아졸리딘 생성 유도 물질이 첨가된 발효식품 원료를 발효시키는 단계;를 포함하고, 발효 전과 비교하여 티아졸리딘 화합물 함량이 증가되어, 최종 발효 식품의 중량 기준으로 티아졸리딘 화합물의 함량이 0.01 mg/L 이상인 것을 특징으로 하는 자연 발효를 통한 기능성 발효식품의 제조 방법 및 이에 의하여 제조된 기능성 발효 식품에 관한 것이다.