According to the present invention, a method for manufacturing fermented soybeans containing lotus roots includes: a soybean and lotus root pretreatment step comprising processes of dewatering 300-500 parts by weight of soybeans soaked in water, washing 100-300 parts by weight of lotus roots, dewatering the lotus roots, and slicing the lotus roots a step of steaming the soybeans and the lotus roots a step of producing a first composition by firstly fermenting the steamed soybeans and steamed lotus roots a step of producing lotus root fermented soybeans by secondly fermenting the first composition in a culturing apparatus after adding Bacillus subtilis and wrapping the first composition with multiple layers of linen fabric a step of drying the lotus root fermented soybeans at 50-60°C for 50-60 minutes with a hot air dryer to make the lotus roots have a moisture content of 7-8% a step of grinding the dried lotus root fermented soybeans a step of producing a third composition by mixing and kneading the second composition with 1300-1600 parts by weight of honey water including pollens a step of producing the third composition into granular fermented soybeans by a granular device and a step of drying the granular fermented soybeans by the hot air dryer to make a moisture content be 7-8%.COPYRIGHT KIPO 2015본 발명의 연근이 함유된 청국장 제조방법은 수침한 대두 300~500중량부를 물기를 빼고, 연근 100~300중량부를 세척한 다음 물기를 뺀 다음 세절하는 공정으로 이루어진 대두와 연근의 전처리 단계와, 상기 대두와 연근을 증자시키는 단계와, 증자된 대두와 연근을 1차 발효시켜 혼합한 제1조성물을 제조단계와, 상기 제1조성물에 고초균을 첨가하고 광목천에 여러겹으로 싼 후 배양기를 통해 2차 발효시켜 연근 청국장을 제조하는 단계와, 상기 연근 청국장을 열풍건조기를 통해 50 내지 60℃에서 50분 내지 60분 동안 건조시켜 연근 청국장이 7~8%의 수분함유율을 갖도록 하는 단계와, 건조된 연근 청국장을 분쇄하는 단계와, 분쇄된 연근 청국장 분말에 양파가루, 연근가루를 혼합하여 제2조성물을 제조하는 단계와, 화분이 첨가된 꿀물 1300 내지 1600중량부에 상기 제2조성물을 혼합 후 반죽하여 제3조성물을 제조하는 단계와, 과립기를 통해 제3조성물을 알갱이 청국장으로 제조하는 단계와, 열풍건조기를 통해 알갱이 청국장을 수분함유량 7~8%으로 건조시키는 단계로 이루어진다.