A capillary electrophoresis method for quantitatively analyzing enoxaparin sodium characteristic oligosaccharide structure is provided in this invention. The method is used for quantitatively determining the content of disaccharides, triaccharides, tetrasaccharides and 1,6-anhydro derivatives with enoxaparin sodium characteristic landmark structure obtained by enzymatic depolymerizing completely of enoxaparin sodium with a mixture of heparinase I, heparinase II and heparinase III so that quantitatively determining the percentage of oligosaccharide chains ending with 1,6-anhydro ring of enoxaparin sodium. The method can be used for the quality control during the process for preparing enoxaparin sodium used as medicine.Linvention concerne un procédé délectrophorèse capillaire permettant danalyser quantitativement une structure doligosaccharides caractéristique de lénoxaparine sodique. Le procédé est utilisé pour déterminer quantitativement la teneur en disaccharides, en triaccharides, en tétrasaccharides et en dérivés 1,6-anhydro présentant une structure de référence caractéristique de lénoxaparine sodique, obtenue par une dépolymérisation enzymatique complète de lénoxaparine sodique au moyen dun mélange dhéparinase I, dhéparinase II et dhéparinase III, afin de déterminer quantitativement le pourcentage de chaînes doligosaccharides se terminant par un noyau 1,6-anhydro dénoxaparine sodique. Ce procédé peut être utilisé pour mettre en oeuvre un contrôle de la qualité pendant le procédé de préparation de lénoxaparine sodique, utilisée comme médicament.