Relates to methods and systems for multistage processing of whole grain flour to reduce the enzymatic activity, and more particularly, the invention, using microwave energy to levels of at least one of these stages and more particularly to high-speed processing of whole grain flour to reduce the lipase enzyme activity in order to extend the shelf life by.本発明は、酵素活性を低減する全粒穀物粉の多段処理のための方法およびシステムに関するものであり、より詳細には、これらの段階のうちの少なくとも1つの段階に対してマイクロ波エネルギーを使用して保管寿命を延ばすためリパーゼ酵素活性を低減する全粒穀物粉の高速処理に関するものである。