An aseptic filling system with online adding of particles includes a filling subsystem and an online particle adding subsystem. The filling subsystem has a first air pump (AP) valve group (11) and an injecting pipe (31) communicated with each other. The online particle adding subsystem has a second AP valve group (21) also communicated with the injecting pipe (31). The invention can realize adding of particles during the production of liquid phase product, and ensure that the final product meets the aseptic requirement.La presente invención se relaciona con un sistema de llenado estéril, y específicamente se relaciona con un sistema de llenado estéril para la adición de partículas en línea que comprende un sistema de llenado, caracterizado en que comprende además un sistema para la adición de partículas en línea. El sistema de llenado comprende un primer banco de válvula AP (11) y una tubería de inyección (31), el primer banco de válvula AP (11) y la tubería de inyección (31) están en conexión uno con otro y el sistema para la adición de partículas en línea comprende un segundo banco de válvula AP (21), el segundo banco de válvula AP (21) está en conexión con la tubería de inyección (31). La presente invención puede alcanzar el objeto de la adición de partículas sólidas durante la producción del producto líquido, y se asegura que el producto terminado resolverá el requerimiento para esterilidad.