The present invention relates to a method for manufacturing a functional coffee, capable of contributing to health promotion while maintaining taste and flavor of a coffee by adding Schisandra chinensis, Lespedeza cuneate, Cornus officinalis to coffee beans. The method for manufacturing a functional coffee comprises the following steps: extracting a coffee bean extract (S10) by pulverizing the coffee beans extract mixing the coffee beans with purified water extracting a Schisandra chinensis extract (S20) by immersing the Schisandra chinensis in the purified water extracting a Lespedeza cuneate extract (S30) by hot water extraction of the Lespedeza cuneate extracting a Cornus officinalis extract (S40) by heating and filtering the Cornus officinalis and mixing sodium hydrogencarbonate, coffee flavor, refined sugar, and purified water (S50) while mixing and concentrating the extracts.COPYRIGHT KIPO 2017본 발명은 원투커피에 오미자, 야관문, 산수유를 포함시켜서 커피의 맛과 향을 유지하면서 건강증진에 기여할 수 있는 기능성 커피 제조 방법에 관한 것이다. 본 발명의 특징은, 원투커피를 분쇄하여 정수와 혼합하여 커피원두추출액을 추출하는 커피원두추출액 추출단계(S10)와, 오미자를 정수에 침지시켜서 오미자추출액을 추출하는 오미자추출액 추출단계(S20)와, 야관문을 열수추출 시켜서 야관문추출액을 추출하는 야관문추출액 추출단계(S30)와, 산수유를 가열하고 여과시켜서 산수유추출액을 추출하는 산수유추출액 추출단계(S40)와, 추출액들을 혼합하여 농축하면서 탄산수소나트륨, 커피향, 정백당, 정제수를 배합하는 추출액배합단계(S50)를 포함한다.