The present invention relates to a novel process for purifying phycocyanins produced by fermenting microalgae, in particular produced by Galdieria sulphuraria, which comprises an enzymatic degradation of glycogen.La présente invention concerne un nouveau procédé de purification de phycocyanines produites par fermentation de microalgues, en particulier produites par Galdieria sulphuraria, qui comprend une dégradation enzymatique du glycogène.