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基于遗传算法和隐马尔可夫模型的CpG岛识别方法、装置
- 专利权人:
- 山东师范大学
- 发明人:
- 刘弘,何演林,郑元杰,赵丹丹,陆佃杰,吕晨
- 申请号：
- CN201710725585.7
- 公开号：
- CN107577918A
- 申请日:
- 2017.08.22
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2018
- 代理人:
- 张勇
- 摘要：
- 本发明涉及一种基于遗传算法和隐马尔可夫模型的CpG岛识别方法，包括以下步骤：1）获取多个包括有基因元素的染色体，每一基因元素均采用实数表示，多个编码染色体构成一组隐马尔可夫模型参数；2)采用适应度函数确定所述每一染色体的适应度值，所述适应度值用来表示染色体优劣程度；3）采用遗传算法，根据所述适应度值，对所述染色体执行寻优过程，然后再重新确定寻优后的染色体适应度值；4）迭代适用步骤3），当满足设定终止条件后，输出最优隐马尔可夫模型参数；5）采用输出的最优隐马尔科夫模型参数，在给定观察序列的基础上，确定生成所述观察序列的最大概率隐藏状态序列，用来表示CpG岛的位置。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址：
- http://www.ckcest.cn/home/
