本发明公开了一种治疗自身免疫性相关疾病的病毒载体及其构建方法和应用，所述病毒载体为克隆有mfat‑1基因的慢病毒表达质粒或克隆有mfat‑1基因的腺相关病毒表达质粒，所述的mfat‑1基因如SEQ ID No.1所示；所述自身免疫性相关疾病包括系统性红斑狼疮，类风湿性关节炎和1型糖尿病。本发明所述的慢病毒(lentivirus)和腺相关病毒(AAV)为载体的病毒载体以及转染至细胞得到的相应病毒颗粒，利用基因重组技术高表达mfat‑1基因，具有显著的抵抗Th细胞分化失衡和炎症、促进胰岛beta‑细胞新生的作用；安全可靠，能满足临床使用需求；制备方法简单，容易操作；具有很好的应用前景。
