A laser eye surgery system focuses light along a beam path to a focal point having a location within a lens of the eye. The refractive index of the lens is determined in response to the location. The lens comprises a surface adjacent a second material having a second refractive index. The beam path extends a distance from the surface to the focal point. The index is determined in response to the distances from the surface to the targeted focal point and from the surface to the actual focal point, which corresponds to a location of a peak intensity of an optical interference signal of the focused light within the lens. The determined refractive index is mapped to a region in the lens, and may be used to generate a gradient index profile of the lens to more accurately place laser beam pulses for incisions.L'invention concerne un système de chirurgie oculaire au laser, qui focalise une lumière le long d'un trajet de faisceau vers un point focal ayant un emplacement dans un cristallin de l'œil. L'indice de réfraction du cristallin est déterminé en réponse à l'emplacement. Le cristallin comprend une surface adjacente à une seconde matière ayant un second indice de réfraction. Le trajet de faisceau s'étend sur une distance de la surface au point focal. L'indice est déterminé en réponse aux distances de la surface au point focal ciblé et de la surface au point focal réel, qui correspond à un emplacement d'une intensité maximale d'un signal d'interférence optique de la lumière focalisée à l'intérieur du cristallin. L'indice de réfraction déterminé est mis en correspondance avec une région dans le cristallin et peut être utilisé pour générer un profil à gradient d'indice du cristallin afin de placer de façon plus précise des impulsions de faisceau laser pour des incisions.