The presently disclosed subject matter provides compositions and methods comprising improvements of a CRISPR system (e.g. CRISPR associated (Cas) 9 (CRISPR-Cas9, non-Cas9 CRISPR systems). Such compositions may comprise modifications to the H1 promoter region, addition of 5'UTR modifications, different orthologous sequences of the H1 promoter, novel compact bidirectional promoter sequences with both pol II and pol III activity, addition of Kozak consensus sequences, termination sequences, addition of conditional pol II/pol III bidirectional promoter expression, addition of a donor template sequence for correcting mutations, or combinations thereof. Other aspects of the invention relate to modifications to Cas9 through post-transcriptional cell-cycle regulation fusions, engineered partial target sites such that the nuclease can bind without DNA cleavage, auto-regulation sites, and N-terminal modifications to modulate half-life.La materia aquí descrita proporciona composiciones y métodos que comprenden mejoras de un sistema CRISPR (por ejemplo, CRISPR-proteína asociada (cas) 9 (sistema CRISPR-cas9, sistemas CRISPR sin cas9). Tales composiciones pueden comprender modificaciones en la región promotora H1, además de modificaciones en UTR 5´, diferentes secuencias ortólogas del promotor H1, nuevas secuencias del promotor bidireccional compacto con actividad tanto Pol II como Pol III, adición de secuencias de consenso de Kozak, secuencias de terminación, adición de la expresión condicional del promotor bidireccional Pol Il/Pol III, adición de una secuencia molde donante para corregir mutaciones, o combinaciones de las mismas. Otros aspectos de la invención se relacionan con modificaciones de cas9 a través de fusiones de regulación postranscripcional del ciclo celular, sitios diana parciales diseñados por ingeniería genética de manera tal que la nucleasa puede unirse a ellos sin escindir el ADN, sitios de autorregulación, y modificaciones n-terminales para modular la semivid
