The invention relates to a method for preparing a protein isolate of the biomass of microalgae of the genus Chlorella, characterised in that it comprises the following steps: supplying a microalgal biomass produced by fermentation； optionally washing the biomass so as to eliminate the soluble interstitial compounds, thermal permeabilisation of the biomass at a temperature of between 50 and 150°C, preferably between 100 and 150°C, for between 10 seconds and 5 minutes, preferably between 10 seconds and 1 minute； elimination of the biomass permeabilised in this way by means of a solid-liquid separation technique selected from the group consisting of frontal or tangential filtration, flocculation and centrifuging, more specifically multi-stage centrifuging, in order to obtain a soluble fraction； optionally recovering and clarifying the soluble fraction thus obtained by microfiltration in such a way as to remove the residual insoluble elements therefrom； ultrafiltration of the soluble fraction on a membrane with a cut-off threshold lower than 5 kDa, preferably between 1 and 5 kDa, in order to produce a soluble protein isolate； then evaporation, pasteurisation and atomisation of said protein isolate.L'invention est relative à un procédé de préparation d'un isolât protéique de la biomasse de microalgues du genre Chlorella, caractérisé en ce qu'il comprend les étapes suivantes : - fourniture d'une biomasse de microalgues produite par fermentation, - de manière optionnelle, lavage de la biomasse de manière à éliminer les composés solubles interstitiels, perméabilisation thermique de la biomasse à une température comprise entre 50 et 150°C, de préférence 100 et 150°C, pendant une durée comprise entre 10 secondes et 5 minutes, de préférence pendant une durée comprise entre 10 secondes et 1 minute, - élimination de la biomasse ainsi perméabilisée par une technique de séparation solide-liquide choisie dans le groupe constitué de la filtration frontale ou tangentielle, la flocula
