Methods and compositions for controlling gene expression are disclosed. According to the present invention, compositions and methods for regulating gene expression of interest are provided. Specifically, a nucleic acid molecule encoding a polypeptide having a DNA binding domain and a looping factor is provided. The DNA binding domain and the looping factor may be linked by a covalent bond or an amino acid linker. In a specific embodiment, the DNA binding domain comprises a zinc finger polypeptide or a transcriptional activator-like effector polypeptide. The DNA binding domain may be designed to specifically bind to a target sequence in a promoter of a target gene and regulate its expression.遺伝子発現を制御する方法および組成物が開示される。本発明によれば、目的遺伝子発現を調節する組成物および方法が提供される。具体的には、DNA結合ドメインおよびルーピング因子を有するポリペプチドをコードする核酸分子が提供される。前記DNA結合ドメインおよび前記ルーピング因子は、共有結合またはアミノ酸リンカーにより連結されてもよい。具体的な実施形態では、前記DNA結合ドメインは、ジンクフィンガーポリペプチドまたは転写活性化物質様エフェクターポリペプチドを有する。前記DNA結合ドメインは、目的遺伝子のプロモーター中の標的配列に特異的に結合してその発現を調節するように設計されてもよい。