A multilayer microencapsulated lactic bacteria and bifidobacteria, preferably bacteria with probiotic activity, and the use thereof to prepare a food product, supplement product, medical device or pharmaceutical composition or water- and/or fruit-based beverage are described. A process for preparing multilayer microencapsulated lactic bacteria and bifidobacteria, preferably bacteria with probiotic activity is described. A food product is described selected from water, water- and/or fruit-based beverages, milk, fresh whole milk, partially skimmed milk, powdered milk, cheese, fresh cheese, aged cheese, grated cheese, butter, margarine, yogurt, cream, milk- and chocolate-based custards, custards for sweets, jams and oily suspensions having bacteria, preferably multilayer microencapsulated lactic bacteria and bifidobacteria with probiotic activity.La présente invention concerne des bactéries lactiques et des bifidobactéries microencapsulées multicouches, de préférence des bactéries présentant une activité probiotique, et l'utilisations de celles-ci dans la préparation d'un produit alimentaire, d'un complément alimentaire, d'un dispositif médical ou d'une composition pharmaceutique ou d'une boisson à base d'eau et/ou de fruits. La présente invention concerne en particulier un produit alimentaire sélectionné parmi de l'eau, des boissons à base d'eau et/ou de fruits, du lait, du lait entier frais, du lait partiellement écrémé, du lait en poudre, du fromage, du fromage frais, du fromage vieilli, du fromage râpé, du beurre, de la margarine, du yogourt, de la crème, des crèmes pâtissières à base de lait et de chocolat, des crèmes pâtissières pour la fabrication de sucreries, des confitures et des suspensions huileuses comprenant des bactéries, de préférence des bactéries lactiques et des bifidobactéries microencapsulées multicouches présentant une activité probiotique. Le matériau de revêtement est sélectionné parmi la liste comprenant des monoglycérides et des diglycérides d