本发明涉及基因工程领域,具体地,本发明涉及一种耐高温酸性β-甘露聚糖酶Man-L30及其基因和应用。本发明的耐高温酸性β-甘露聚糖酶Man-L30,其氨基酸序列如SEQ ID NO.1或2所示。本发明的耐高温酸性β-甘露聚糖酶基因man-L30,编码权利要求1所述的耐高温酸性β-甘露聚糖酶Man-L30,其核苷酸序列如SEQ ID NO.4或5所示。本发明的β-甘露聚糖酶Man-L30同时具有耐高温、良好的pH稳定性和蛋白酶抗性等特点。最适pH为5.5,在pH2.5-pH6.5范围内,该酶能够维持其65%以上的酶活力;最适温度50℃,具有极好的抗胃蛋白酶和胰蛋白酶处理能力。可应用于饲料、食品、医药等工业领域。