Aspect of the problem] The present invention relates to a purification method of chondroitinase and stable formulation of chondroitinase. A step of separating the chondroitinase from the crude cell extract using an extracting step, the cation exchange chromatography from a cell, a method of purifying [SOLUTION] chondroitinase, gel filtration chromatography the enzyme and also has a step of removing impurities by Photography, and a step of removing the producing purified chondroitinase to remove endotoxin by anion exchange membrane. [Selection] Figure 12【課題】本発明の観点は、コンドロイチン分解酵素の安定製剤及びコンドロイチン分解酵素の精製方法に関するものである。【解決手段】コンドロイチン分解酵素を精製する方法は、前記酵素を細胞から抽出する工程と、陽イオン交換クロマトグラフィーを用いて前記粗細胞抽出物から前記コンドロイチン分解酵素を分離する工程と、ゲルろ過クロマトグラフィーにより不純物を除去する工程と、陰イオン交換膜によりエンドトキシンを除去して精製コンドロイチン分解酵素を生成する前記除去する工程とを有するものである。【選択図】図12