PROBLEM TO BE SOLVED: To provide an identification device capable of accurately identifying a tooth type, a scanner system including the identification device, an identification method, and an identification program. An identification device (100) is based on an input unit (1102) to which three-dimensional data including teeth is input, and an estimation model (114) including three-dimensional data including tooth features input from the input unit (1102) and a neural network (1142). The estimation model 114 includes an identification unit 1130 for identifying the tooth type and an output unit 1103 for outputting the identification result by the identification unit 1130, and the estimation model 114 stores tooth information corresponding to the tooth type associated with the three-dimensional data. , Based on the identification result of the tooth type using the three-dimensional data. [Selection diagram] Fig. 5【課題】精度良く歯牙の種類を識別することができる識別装置、当該識別装置を備えるスキャナシステム、識別方法、および識別用プログラムを提供する。【解決手段】識別装置100は、歯牙を含む三次元データが入力される入力部1102と、入力部1102から入力された歯牙の特徴を含む三次元データおよびニューラルネットワーク1142を含む推定モデル114に基づき、当該歯牙の種類を識別する識別部1130と、識別部1130による識別結果を出力する出力部1103とを備え、推定モデル114は、三次元データに関連付けられた歯牙の種類に対応する歯牙情報と、当該三次元データを用いた当該歯牙の種類の識別結果とに基づき学習される。【選択図】図5