本发明公开了一种来源于白三叶(Trifolium repens.L)的白三叶Na+/H+逆向转运蛋白基因TrNHX1及其编码蛋白与应用。该基因是下列核苷酸序列之一:1)序列表中的SEQ ID No:1;2)编码序列表中SEQ ID No:2蛋白质序列的多核苷酸;3)与序列表中的SEQ ID No:1限定的DNA序列具有70%以上同源性,且编码相同功能蛋白质的DNA序列。通过TrNHX1与盐敏感的酵母单、双突变体进行的功能互补实验结果表明,该基因能在一定程度上恢复其抗盐能力。本发明的基因可以用于转化白三叶、豆科植物及其它植物,培育植物耐盐新品种或其他生物学性状得到改善的转基因植物新品种。