A method and medical system for estimating the deformation of an anatomic structure that comprises generating a first model of at least one anatomical passageway from anatomical data describing a patient anatomy and determining a shape of a device positioned within the branched anatomical passageways. The method and medical system also comprise generating a second model of the plurality of branched anatomical passageways by adjusting the first model relative to the determined shape of the device.La présente invention concerne un procédé et un système médical pour estimer la déformation dune structure anatomique qui comprend la génération dun premier modèle dau moins une voie de passage anatomique à partir de données anatomiques décrivant lanatomie dun patient et la détermination dune forme dun dispositif positionné dans les voies de passage anatomiques branchées. Le procédé et le système médical comprennent en outre la génération dun deuxième modèle de la pluralité de voies de passage anatomiques branchées par ajustement du premier modèle par rapport à la forme déterminée du dispositif.