L' invention concerne un système et un procédé pour estimer des paramètres hémodynamiques par application de méthodes probabilistes douces à l'imagerie de perfusion. Un tel procédé permet en outre d'estimer des fonctions de répartition complémentaire ou d'entrée artérielles et donc plus généralement toute quantité d'intérêt. L'invention se distingue notamment des procédés connus en ce quelle requière l'introduction a priori d' informations strictement douces de nature physiologique ou hémodynamique sans contraindre ni forcer l'estimation recherchée par des hypothèses arbitraires et indésirables.