A device for eliminating pathogens, used in an aquarium includes a first conductive mesh, a second conductive mesh, and a spacer located in between the first and second conductive meshes for insulating the first and second conductive meshes. Disclosed is a controller of the eliminating device used in an aquarium characterized by alternately applying polarity of voltage to the first and second conductive meshes.COPYRIGHT KIPO 2014[Reference numerals] (120) Controller (130) Power supply수족관에 사용되는 사멸 장치의 컨트롤러에 있어서, 상기 사멸 장치는, 제1 전도성 메쉬, 제2 전도성 메쉬, 및 제1 전도성 메쉬와 제2 전도성 메쉬 사이에 위치되어, 제1 전도성 메쉬와 제2 전도성 메쉬를 절연시키는 스페이서를 포함하고, 상기 컨트롤러는 상기 제1 전도성 메쉬와 상기 제2 전도성 메쉬에 전압의 극성을 교번적으로 인가하는 것을 특징으로 하는 수족관에 사용되는 사멸 장치의 컨트롤러가 개시된다.