The present invention relates to a lipase which has an amino acid sequence represented by sequence number 2, and which specifically hydrolyzes or esterifies only an sn-1 site of glycerin fatty acid ester. The present invention also relates to a production method thereof using Pichia yeast. According to the present invention, the use of the Cordyceps militaris-derived site-specific lipase targeting sn-1 enables the highly efficient production of biologically active substances and specific restructured lipids such as 1-monoglyceride and 2,3-diglyceride, as the site-specific lipase specifically acts on a number 1 site on a skeletal structure of glycerol.본 발명은 글리세린 지방산 에스테르의 sn-1 위치만을 특이적으로 가수분해 또는 에스테르화하는 서열번호 2의 아미노산 서열을 갖는 리파아제 및 피키아(Pichia) 효모를 이용한 그것의 생산방법에 관한 것으로, 본 발명의 코디셉스 밀리타리스 유래의 sn-1 위치 특이적 라이페이스를 이용할 경우, 글리세롤 골격구조의 1번 위치에만 특이적으로 작용함으로써 1-모노글리세라이드 및 2,3-다이글리세라이드와 같은 특이한 재구성 지방질 및 생리활성 물질을 고효율로 생산하는데 적용할 수 있다.