The present invention relates to a natural extract composition containing physiologically active substances derived from natural extract and a method for preparing the same, and more specifically, to a method for preparing a natural extract composition including the following steps, a natural extract composition prepared by the method, and a functional food using the natural extract composition. According to the present invention, the method includes the steps of: (1) weighing and preparing the medicinal parts of the origin plants of safflowers, Acanthopanacis Senticosi Radix et Rhizoma, corydalis, Achyranthes roots, Eucommia bark, and Moringa oleifera Lam. (2) washing the weighed medicinal parts (3) drying the washed medicinal parts in a dryer at temperatures of 85°C for 4-24 hours so the moisture content falls down below 1% (4) grinding the dried medicinal parts and obtaining a mixture by mixing the ground medicinal parts (5) adding purified water at the weight ratio of 10-20 times with respect to the total weight of the mixture and obtaining extract in hot water at temperatures of 100°C for 8-10 hours (6) inserting the extract in a storage tank and adding water at the weight ratio of 10-20 times with respect to the total weight of the extract (7) performing extraction at 80°C for 4-5 hours (8) centrifugally separating the extract by using a centrifuge (9) filtering the extract by using a micro filter to obtain filtrate and (10) concentrating the filtrate by using a rotary evaporator.COPYRIGHT KIPO 2018본 발명은 천연물 유래 생리활성 물질을 포함하는 복합 천연물 조성물 및 그 제조방법에 관한 것으로서, 보다 상세하게는 기원식물인 홍화(紅花), 자오가(刺五加), 연호삭(延胡索), 우슬(牛膝), 두충(杜沖) 및 랄목(辣木)의 약용부위를 칭량하여 준비하고, 그 칭량된 상기 각각의 약용부위를 세척한 다음 건조기에서 85℃의 온도조건하에 4~24시간 동안 함수율 1%이하가 되도록 건조하고, 그 건조물을 마쇄한 다음 그 마쇄물을 혼합하고, 그 혼합물 총량에 대하여, 중량기준으로 10~20배의 중량비로 정제수를 가하여 100℃의 열수에서 8~10시간 동안 열수 추출하고, 그 추출액을 저장조에 넣고 상기 추출액 총량 대비 10~20배의 중량비로 투입 후, 80℃의 온도조건하에 4~5시간 추출한 후, 원심분리기로 원심분리한 후, 마이크로필터로 여과하여 여과액을 회전감압농축기로 농축하는 과정을 포함하여 이루어지는 천연물 유래 생리