This disclosure relates to methods of detecting and quantifying low concentrations of cells in a sample with targeted nanoparticles having Raman reporters using surface-enhanced Raman scattering for detection. In certain embodiments, the sample is a group of cells derived from stem cells that have been differentiated into specific cell types and one is detecting residual stem cells or other progeny in order to quantify the purity of the sample. In certain embodiments, the targeted nanoparticles contain two or more Raman reporters for the purpose of multiplexing. In certain embodiments, purity measurements are used to make quality control determinations.La présente invention concerne des procédés de détection et de quantification de faibles concentrations de cellules dans un échantillon avec des nanoparticules ciblées ayant des rapporteurs Raman utilisant une diffusion Raman améliorée en surface en vue d'une détection. Dans certains modes de réalisation, l'échantillon est un groupe de cellules obtenues à partir de cellules souches qui ont été différenciées en types de cellules spécifiques, dont l'un détecte des cellules souches résiduelles ou une autre descendance pour quantifier la pureté de l'échantillon. Dans certains modes de réalisation, les nanoparticules ciblées contiennent au moins deux rapporteurs Raman en vue d'un multiplexage. Dans certains modes de réalisation, des mesures de pureté sont utilisées pour réaliser des déterminations de contrôle de qualité.