A system for creating a replacement anatomical structure includes a quantitative three-dimensional (Q3D) endoscope arranged to image a structure in a field of view containing a target tissue, and at least one processor comprising a target bone Creating a first Q3D model of the anatomy including the tissue, creating a second Q3D model of the anatomy including the remaining tissue at the location where the target was the removed tissue, and And at least one processor configured to create a third Q3D model of the replacement structure based at least in part on the first Q3D model and the second Q3D model.置換解剖学的構造を作るためのシステムは、標的組織を含む視野内の構造を撮像するように配置される定量的3次元(Q3D)内視鏡と、少なくとも1つのプロセッサであって、標的骨組織を含む解剖学的構造の第1のQ3Dモデルを作るように、 標的が除去された組織であった位置における残りの組織を含む解剖学的構造の第2のQ3Dモデルを作るように、及び 第1のQ3Dモデル及び第2のQ3Dモデルに少なくとも部分的に基づいて置換構造の第3のQ3Dモデルを作るように、構成される、少なくとも1つのプロセッサと、を有する。