本发明涉及基因工程和遗传工程领域,具体地,本发明涉及高催化效率β-葡萄糖苷酶突变体M36E及其编码基因和应用。本发明所述耐热性β-葡萄糖苷酶的突变体M36E,以来源于嗜热真菌篮状菌Talaromyces leycettanus JCM12802的高温酸性β-葡萄糖苷酶BGL3A为母本,采用分子生物学技术对β-葡萄糖苷酶序列进行定点突变,氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。在此改造条件下,突变体对纤维二糖的亲和力比野生型(突变前)均提高2.1倍,催化效率提高2.3倍,且最适反应pH值和温度不变。利用此策略可以大大提高β-葡萄糖苷酶的催化效率,为其在食品、生物乙醇等工业生产领域提供了应用基础。此策略对β-葡萄糖苷酶及其它酶的催化效率提高具有重要的指导意义。