The present invention provides a process for the preparation of a stable polymorph III of Atovaquone exhibiting characteristic peaks (expressed in degrees 2θ±0.2°θ) at about 6.9, 9.6, 14.1, 14.7, 17.0, 18.5, 19.1, 19.9, 20.3, 22.0, 22.6, 23.2, 24.2, 26.8, and 28.5, which comprises: (a) providing a sample of Atovaquone particles (b) heating the sample of Atovaquone particles at a minimal temperature of between 140 °C to 160 °C depending on the particle size of the sample and (c) cooling the sample to obtain the stable polymorphic form of Atovaquone.La présente invention concerne un procédé pour la préparation dune forme stable polymorphe III dAtovaquone montrant des pics caractéristiques (exprimés en degrés 2θ ± 0,2°θ) à environ 6,9, 9,6, 14,1, 14,7, 17,0, 18,5, 19,1, 19,9, 20,3, 22,0, 22,6, 23,2, 24,2, 26,8, et 28,5, qui comprend: (a) lobtention dun échantillon de particules dAtovaquone (b) le chauffage de léchantillon de particules dAtovaquone à une température minimale entre 140°C à 160°C en fonction de la taille des particules de léchantillon et (c) le refroidissement de léchantillon pour obtenir la forme stable polymorphe dAtovaquone.