基因mRNA的m6A单碱基位点鉴定方法
- 专利权人:
- 浙江大学
- 发明人:
- 汪以真,王新霞,蔡旻,江芹
- 申请号:
- CN201610799660.X
- 公开号:
- CN106399488A
- 申请日:
- 2016.08.31
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2017
- 代理人:
- 金祺
- 摘要:
- 本发明公开了一种基因mRNA的m6A单碱基位点鉴定方法,包括以下步骤:1)、将样品进行高通量测序,根据测序结果挑选出靶基因,并确定其m6A峰大致位置;2)、利用在线工具SRAMP得到该基因的m6A峰区域序列中所有可能存在m6A位点信息;3)、构建该基因的超表达载体和突变载体;4)、将步骤3)得到的两种载体分别转染细胞,收集细胞提取RNA;5)、将步骤4)得到的富集的含有m6A的RNA反转录为cDNA,设计各个突变位点区域的荧光定量引物;将超表达载体组和突变载体组的荧光定量结果比较,若某位点突变载体组结果小于超表达载体组且P<0.05,则判定该位点是m6A位点。
- 来源网站:
- 中国工程科技知识中心