The position detection system includes a capsule endoscope 10 in which a magnetic field generator for generating a magnetic field is provided, a plurality of detection coils C for outputting detection signals of the magnetic fieldN, A detection coil CNA position detection calculation unit 564 for calculating the position of the capsule endoscope 10 using the detection signal outputted by the capsule endoscope 10, a determination unit 563 for determining whether or not the proper position detection of the capsule endoscope 10 is possible, And a threshold holding unit 562 for holding a threshold value used for the determination. The threshold value is a value obtained by multiplying a plurality of detection coils CN, And the judgment unit 563 judges whether or not a plurality of detection coils CN, And determines that the proper position detection of the capsule endoscope 10 is impossible when the determined value is less than the threshold value. Thereby, a position detection system capable of preventing inappropriate output of the position detection result of the capsule medical device can be provided.位置検出システムは、磁界を発生する磁界発生部が内部に設けられたカプセル型内視鏡10と、該磁界の検出信号を出力する複数の検出コイルCnと、検出コイルCnが出力した検出信号を用いてカプセル型内視鏡10の位置を算出する位置検出演算部564と、カプセル型内視鏡10の適正な位置検出が可能か否かを判定する判定部563と、該判定に用いられる閾値を保持する閾値保持部562とを有し、該閾値は、所定の条件の下での複数の検出コイルCnからの少なくとも1つの出力値に基づく値であり、判定部563は、複数の検出コイルCnからの出力値のうちの少なくとも1つを用いて判定値を決定し、該判定値が閾値未満である場合にカプセル型内視鏡10の適正な位置検出が不可能と判定する。これにより、カプセル型医療装置の位置検出結果の不適正な出力を防ぐことができる位置検出システムを提供する。